Die Archive der Universitäten, Hochschulen und Fachhochschulen des Freistaats Thüringen übernehmen, erschließen und bewahren die an den jeweiligen Bildungseinrichtungen entstehenden Dokumente. Auf der Grundlage des Thüringer Archivgesetzes unterhalten zahlreiche Hochschulen im Freistaat eigene Endarchive, die mit ihren Beständen sowohl die Institutionsgeschichte als auch die Entwicklung von Forschung und Lehre in Thüringen dokumentieren und diese Quellen der öffentlichen Benutzung zugänglich machen. Die Archive übernehmen auch Nachlässe der Professoren, Dozenten und Wissenschaftler, die an der Einrichtung tätig waren und dokumentieren die Arbeit unabhängiger Gremien innerhalb der Einrichtung sowie studentische Aktivitäten. Das größte Hochschularchiv in Thüringen ist das Archiv der Friedrich-Schiller-Universität Jena, dessen Bestände vom 16. Jahrhundert bis zur Gegenwart reichen. Eine Sonderstellung nimmt das Archiv der Hochschule für Musik FRANZ LISTZ Weimar ein, da es gleichzeitig Landesmusikarchiv ist. Die Thüringer Hochschularchive arbeiten im Arbeitskreis Thüringer Universitäts- und Hochschularchive im Landesverband Thüringen des VdA zusammen.